根據(jù)國(guó)家稅務(wù)總局公告2025年第1號(hào)結(jié)合匯總納稅企業(yè)申報(bào)情況，優(yōu)化總分機(jī)構(gòu)分?jǐn)偠惪钣?jì)算方法，并對(duì)《跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)年度分?jǐn)偲髽I(yè)所得稅明細(xì)表》(A109000)及《企業(yè)所得稅匯總納稅分支機(jī)構(gòu)所得稅分配表》(A109010)的表樣和填報(bào)說(shuō)明進(jìn)行調(diào)整。按照調(diào)整后的規(guī)則，企業(yè)先對(duì)全年應(yīng)納稅款進(jìn)行分?jǐn)偅儆煽?、分機(jī)構(gòu)分別抵減其已分?jǐn)傤A(yù)繳稅款，并計(jì)算本年應(yīng)補(bǔ)退稅金額。

根據(jù)《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于<印發(fā)跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法>的公告》(國(guó)家稅務(wù)總局公告2012年第57號(hào))第五條規(guī)定：當(dāng)年撤銷(xiāo)的二級(jí)分支機(jī)構(gòu)，自辦理注銷(xiāo)稅務(wù)登記之日所屬企業(yè)所得稅預(yù)繳期間起，不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅。

那么，當(dāng)年度內(nèi)發(fā)生二級(jí)分支機(jī)構(gòu)注銷(xiāo)情形，補(bǔ)稅情況較之前是否會(huì)發(fā)生變化，或?qū)е露嗬U納稅款呢?

【案例】甲公司是2023年在北京市注冊(cè)成立的企業(yè)，不屬于小型微利企業(yè)。甲公司分別在山東省、天津市、河北省設(shè)立了分支機(jī)構(gòu)A、B、C。2024年，甲企業(yè)全年預(yù)繳了250萬(wàn)元，其中，總機(jī)構(gòu)預(yù)繳了125萬(wàn)元，A、B和C按照50%、30%、20%的分?jǐn)偙壤?，分別預(yù)繳了62.5萬(wàn)元、37.5萬(wàn)元、25萬(wàn)元。甲公司2024年度匯繳應(yīng)納稅額300萬(wàn)元，其中2024年10月B分支機(jī)構(gòu)注銷(xiāo)，A的分配比例是70%，C的分配比例是30%。

1.原計(jì)算方法

第一步，整體計(jì)算企業(yè)本年應(yīng)補(bǔ)(退)稅額。

甲企業(yè)應(yīng)補(bǔ)(退)稅額：300-250=50萬(wàn)元

第二步，根據(jù)分?jǐn)偙壤謩e計(jì)算總分機(jī)構(gòu)應(yīng)補(bǔ)退稅額。

總機(jī)構(gòu)應(yīng)補(bǔ)(退)稅額：50×50%=25萬(wàn)元

分支機(jī)構(gòu)A應(yīng)補(bǔ)(退)稅額：50×50%×70%=17.5萬(wàn)元

分支機(jī)構(gòu)C應(yīng)補(bǔ)(退)稅額：50×50%×30%=7.5萬(wàn)元

2.新計(jì)算方法

第一步，根據(jù)分?jǐn)偙壤?jì)算總分機(jī)構(gòu)全年實(shí)際應(yīng)納所得稅額。

甲企業(yè)：300萬(wàn)元

總機(jī)構(gòu)：300×50%=150萬(wàn)元

分支機(jī)構(gòu)A：300×50%×70%=105萬(wàn)元

分支機(jī)構(gòu)B：300×50%×0%=0萬(wàn)元

分支機(jī)構(gòu)C：300×50%×30%=45萬(wàn)元

第二步，計(jì)算總分機(jī)構(gòu)分?jǐn)倯?yīng)補(bǔ)(退)所得稅額。

總機(jī)構(gòu)應(yīng)補(bǔ)(退)稅額：150-125=25萬(wàn)元

分支機(jī)構(gòu)A應(yīng)補(bǔ)(退)稅額：105-62.5=42.5萬(wàn)元

分支機(jī)構(gòu)B應(yīng)補(bǔ)(退)稅額：0-37.5=-37.5萬(wàn)元

分支機(jī)構(gòu)C應(yīng)補(bǔ)(退)稅額：45-25=20萬(wàn)元

案例中，由于分支機(jī)構(gòu)B在預(yù)繳環(huán)節(jié)已經(jīng)注銷(xiāo)，按新計(jì)算方法計(jì)算后，分支機(jī)構(gòu)A在匯算清繳時(shí)應(yīng)補(bǔ)稅42.5萬(wàn)元，分支機(jī)構(gòu)C應(yīng)補(bǔ)稅20萬(wàn)元，導(dǎo)致分支機(jī)構(gòu)合計(jì)補(bǔ)稅的稅款大于實(shí)際應(yīng)補(bǔ)稅款25萬(wàn)元。只有將分支機(jī)構(gòu)預(yù)繳期間的稅款返還給公司，公司預(yù)繳稅款才等于實(shí)際應(yīng)預(yù)繳稅款。但是分支機(jī)構(gòu)B已經(jīng)注銷(xiāo)，如何將稅款退還，實(shí)操如何進(jìn)行，建議國(guó)稅總局提供后續(xù)具體指引。

建議可在分支機(jī)構(gòu)B注銷(xiāo)環(huán)節(jié)，主管稅務(wù)局將預(yù)繳的企業(yè)所得稅就返還至分支機(jī)構(gòu)的稅款戶(hù)中。

（作者及單位：紅塔證券股份有限公司  資金財(cái)務(wù)部  張艷萍）